城市中出現了來歷不明的光病毒。SRC中的Eyes隊成員為要確認光源搜尋至鏑矢島，遇上了對怪獸充滿愛心的預備飛行員春野武藏。此時，光病毒入侵怪獸力特里亞斯體內，力失控，Eyes準備向力發動攻擊，武藏決要阻止，危急中，超人高斯終於回來电影中的情感张力十足，让人感同身受！...

吸收怪獸鴉王出現了，在大地上肆意破壞！正在巡邏的飛鳥就變身成超人帝拿跟怪獸打起來，可是其絕招卻被怪獸的三隻角吸收掉了。像在嘲笑超人的失敗似的，怪獸與光線一起消失了。阿響隊長之下的各隊員召開了緊急會議。推測怪獸的出現應該是與Miji星球人有關，但這卻怪錯好人了。不過，那個真正的侵略者∼機械魔女（人形機械人）卻在暗地里進行著其侵略地球的大計。終於，怪獸鴉王與能量鎖合體變成了合體侵略兵器獸溫哲。飛鳥再次...

21世纪，地球回复昔日的和平，但此时宇宙坠下一颗陨石，陨石有一个人工的时空囊。地球和平联盟TPC的GUTS小队通过时空囊了解到地球将有大灾难发生。而此时，时空囊预言的两大怪兽·“哥路渣”和“米路巴”先后出现，GUTS小队便根据预言寻找收藏在金字塔的三大巨人的身体。几经寻找后GUTS队员们终于找到金字塔，但两大怪兽也到来了。虽GUTS拼死守护，但三个巨像已被破坏剩一个，队员·大伍的战机也被击中，且逃...