电视动画《灼眼的夏娜Ⅲ-FINAL-（灼眼のシャナⅢ-FINAL-）》是由日本小说家高桥弥七郎所著的轻小说《灼眼的夏娜》改编的同名动画《灼眼的夏娜》的第三期作品。平时总爱发呆，有点弱气的男主角坂井悠二和往常一样过着平凡的日子，怪物的突然出现打破了他原有的生活。夕阳下，将人的“存在”化作灵火后吞噬的异界怪物突然袭击了悠二。这个时候，出现了一位自称“炎发灼眼的讨伐者”的少女从怪物口中救下悠二，坂井悠二...

在远古的时代，宇宙中存在着分别代表光明与黑暗的两个文明，正如光与影永远是相互矛盾的，两个文明也长年处于战争之中，代表黑暗的文明为了取得胜利，就制造了一种高科技的战舰，这种战舰拥有超强的作战能力及穿越时空的能力，而且，还拥有自己的思想。然而，这种战舰却会把驾驶者作为自己的食粮，以此来增强自己的力量。这种黑色的战舰就像魔鬼一样，会把敌人彻底毁灭，但同时也会吞噬驾驶员的生命。而在同一时间，为了对抗敌人的...

故事的主角纱伊阿九斗，为了替社会尽一份心力而转入康士坦魔术学院就读，并以成为国家一级魔法师为目标而决心努力。没想到第一天上课的就获得一段内容相当夸张的预言，拜预言所赐，等待他的是堪称多灾多难的校园生活。他将面对被身为班长的女同学怨恨、被一名拥有不可思议能力的少女黏着不放，甚至还遭到帝国监察员的少女型人造人随时跟监等……...